10444. トレーサーとしてのE484K単独変異株

日本固有のN501YがなくE484Kだけを持つR.1系統ウイルスが、東京から仙台に持ち込まれたことが明確になった。

震災のセレモニーで東京から大勢のマスコミ他の人が移動して、集まった結果だと、これではっきりする。

ウイルスの変異解析ってのは、トレーサーとしては有用です。

以前の日本は、大阪も東京も同じ株だったけど(細かく見ればB1.1.284とB1.1.214の2系統あったが)今回は、関西がイギリス型、関東がR.1系統と分かれてるから、人の移動でウイルスが持ち込まれているのがよく見える。

特に、R.1系統は「オリジンはどうであれ、少なくとも2021年になってからは東京から拡散して行ったもの」として断定しても構わないくらい、地域限定なので。

とてもわかりやすい.

東京から仙台に行った人が、何をして、あの地域に「置き土産」して来たのか? 地元の人なら彼らの騒ぎっぷりを知ってるだろう。

あるいは、仙台から東京に行った人が、何をして持ち帰って、それを地元で何をして広めたのか?

極めて明確にわかる。

人の移動そのものは「悪」ではないけど、家(の台所)を持たない旅行者は、どこかで外食することになる。

それが「コンビニ弁当持ち帰り=ホテルで個食」ならいいけど、接待宴会(コンパニオン付き)だとか、イベント参加後に大勢で懇親会だとか、久しぶりに会った友人と少人数でも「ゆっくり」と食事をしながら飲みながら語らいだとか、が、よく無いってことが、これではっきりしたよ。

仙台には押谷組がいる。いずれ、R.1株を追跡して論文にしてくれるだろう。期待しています。

これまでに新型コロナの「波」を経験してない地域は、病院の方が対応に慣れてなくて苦労されると思う。

一方で、弘前がそうだったように、「繁華街」が限定されてる地域は、そこから人が居なくなれば、収束への道はつけやすい。

まぁ、これもオリンピック無理〜ってなるためには必要な布石なんだろう、知らんけど。

10441. E484KのみでN501Yを持たないR.1は

10439. 私はこの分野は素人なのですが

165番組の途中ですがアフィサイトへの転載は禁止です (ドコグロ MM89-/kMU)2021/04/05(月) 02:11:42.48ID:jCpUJ/9uM Result of Nextclade analysis of 860 samples of R.1 Lineage (S:E484K) in Japan.
2021-04-04

metadata tsv
https://pastebin.pl/view/b0d3651a
Identified mutation sites (csv)
https://pastebin.pl/view/ede189f5
sequences.fasta
https://anonymousfiles.io/B7lIlMBb/
auspice.json for https://auspice.us/
https://anonymousfiles.io/qIJnaipi/

Ref.
https://cmg.med.keio.ac.jp/covid19/